To Ινστιτούτο Μηχανικής Φυσικών Κινδύνων αποτελεί μονάδα του Πανεπιστημιακού Ερευνητικού Κέντρου του Ιονίου Πανεπιστημίου και διοικείται κατά τα προβλεπόμενα από τον Εσωτερικό Κανονισμό αυτού.
Οι Πόροι του Ινστιτούτου προέρχονται από πηγές, όπως αυτές που ορίζονται στον Εσωτερικό Κανονισμό του ΠΕΚ-ΙΠ. Η διαχείριση των πόρων του Ινστιτούτου γίνεται κατά τα αναφερόμενα στον Εσωτερικό Κανονισμό του ΠΕΚ-ΙΠ.
Διευθυντής του Ινστιτούτου Μηχανικής Φυσικών Κινδύνων είναι ο Ιωάννης Καρύδης, Αν. Καθηγητής του Τμήματος Πληροφορικής.
