Το Ινστιτούτο αποτελεί μονάδα του ΠΑΠΕΚ και διοικείται κατά τα προβλεπόμενα από τον Εσωτερικό Κανονισμό αυτού. Στο Ινστιτούτο προβλέπεται η άμεση οργάνωση τουλάχιστον τριών Ερευνητικών Ομάδων (ΕΟ).
Σύμφωνα με τον Εσωτερικό Κανονισμό του ΠΑΠΕΚ, το διοικητικό οργανωτικό σχήμα του Ινστιτούτου αποτελείται από:
Την Διευθύντρια:
- Αικατερίνη Καμπάση, Καθηγήτρια Τμήματος Περιβάλλοντος
Τη Συντονιστική Επιτροπή Ινστιτούτου (ΣΕΙ):
- Αικατερίνη Καμπάση, Καθηγήτρια Τμήματος Περιβάλλοντος
- Θεμιστοκλής Έξαρχος, Αναπληρωτής Καθηγητής Τμήματος Πληροφορικής
- Μιχαήλ Παναγόπουλος, Αναπληρωτής Καθηγητής Τμήματος Τεχνών Ήχου και Εικόνας
Τους επικεφαλής των Ερευνητικών Ομάδων (ΟΕ)
